De maneira alto nível você identifica o problema observando a aba de entrada do controle de volume.
Veja se sua aba está como abaixo:
Em geral a tela deveria vir acompanhada de um campo “Conector” do qual você pode controlar o volume ou qual o conector você quer usar de modo individual.
Pois bem, a tela deveria está assim:
Observe que agora você pode escolher o conector. Não importa se você está num notebook, que geralmente só tem uma entrada de microfone (há notebooks que vem com microfone embutido) tem que aparecer o campo de seleção de conector. Selecione o conector do qual seu microfone está conectado e ajuste o volume para usar.
Mas, como eu realizo a mágica de aparecer o campo?
O problema está no driver alsa que em determinadas placas de som não funciona.
Primeiro identifique a versão do alsa.
Se a versão menor que 1.0.23 você é candidato a usar a solução a seguir.cat /proc/asound/version
Faça:
Após instalado é necessário reiniciar o computador. Epa, reiniciar um linux? É… essa instalação gera um novo initrd e para funcionar (por enquanto) é necessário reiniciar o ubuntu.sudo aptitude install linux-backports-modules-alsa-lucid-generic
PS.: isso também resolve o problema com microfone no gtk recordmydesktop
fonte: http://romulojales.com/?p=127